本路線提供屯門碼頭、美樂花園、龍門居、豐景園、恆福花園、兆麟苑、置樂花園、屯門市中心、新墟及紅橋往來深圳灣口岸的特別巴士服務，於2024年2月10日（大年初一）至2月14日（年初四）凌晨時段首次提供服務。

新冠疫情於2023年開始緩和，同年12月31日為防疫措施解除後首個大除夕，歷來規模最大的除夕維港煙花倒數在1月1日凌晨上演，除夕當日全日有19.5萬內地遊客來港，破盡疫情後通關單日紀錄。與過往疫前除夕節日不同，大批內地遊客於倒數後並無逼留在香港過夜，而是即時返回內地，由於當時只有皇崗口岸及港珠澳大橋香港口岸提供24小時通關，而往返深圳的24小時通關口岸卻只有皇崗口岸一個，結果導致大批內地旅客逼爆多個跨境巴士及火車站，場面混亂。

特區政府在元旦凌晨過境旅客混亂發生後，即和深圳當局商討在大型節日及長假期期間的過境安排，2024年1月23日，經深港兩地政府協商，並報國家口岸管理辦公室批准，深圳灣口岸旅檢通道2月9日至2月13日（年三十至年初四）臨時實施24小時通關。為配合該項安排，城巴於深圳灣口岸實施24小時通關期間（2月10日至2月14日的凌晨時段），增設一條通宵服務的特快巴士路線NB3（即本路線），往返屯門碼頭至深圳灣口岸，走線與日間的B3線相約，但往深圳灣口岸改停屯門市廣場（屯喜路）而不停屯門鄉事會路，來回程並停靠新墟及紅橋巴士站，並設短程特別班次，往返屯門市廣場至深圳灣口岸，方便農曆新年假期期間需要於深宵往返深港兩地的市民及過境旅客。

2025年1月1日凌晨，旅發局再次舉行除夕維港煙花倒數，為便利元旦假期旅客通關順暢，深圳市政府已批准於2024年12月31日晚上，深圳灣口岸旅客及行車實行24小時通關，為配合該項安排，本路線亦於當日凌晨提供服務。

而本路線的深圳灣口岸總站（港方管轄區），實際上位於深圳市南山區的東角頭，因此本路線實際上是過境巴士路線，不過由於深圳灣口岸本身屬「一地兩檢」，深圳灣公路大橋及深圳灣口岸港方口岸區均實行香港特別行政區法律，因此城巴並沒有將本路線列為過境路線。本路線為NB2線為首兩條於深宵提供服務的深圳灣口岸（港方口岸區）巴士路線。