本路線提供將軍澳康盛花園、翠林、寶林、坑口、寶盈花園／將軍澳廣場、將軍澳站、將軍澳中心、偉業街（麗港公園）往返大老山隧道、香港科學園、白石角、運頭塘、廣福、大埔超級城、太和、汀太路、太平工業中心、富亨、魚角及大埔工業邨的巴士服務，去程加停茶果嶺村，是《2021-2022年度巴士路線計劃》建議開辦的全新招標路線，於2022年12月12日起投入服務，以配合將軍澳—藍田隧道於前一天（12月11日）落成通車，初時袛在星期一至五早晚繁忙時間各對開兩班。

未有本路線以前，將軍澳與大埔之間一直未有常規巴士服務直達兩地，居民需要乘搭巴士往返觀塘市中心轉乘九巴74X線，或乘搭新巴798線於大老山隧道轉乘往返大埔的巴士路線、或於沙田站轉乘港鐵，若前往遠離大埔市中心的地區更需多轉一程車，十分不便。而且74X線本身長期飽和，往大埔方向要繞經新蒲崗及鑽石山才能駛入大老山隧道，進一步加長行車時間。

鑑於往來將軍澳至大埔的通勤需求有持續增加趨勢，當局於《2021-2022年度巴士路線計劃》，建議開辦一條全新路線，往返康盛花園至大埔工業邨，建議星期一至五早晚繁忙時間各對開兩班，並以招標形式決定營運巴士公司。適逢將軍澳—藍田隧道及將軍澳跨灣連接路（該兩條幹線於2022年11月25日正式命名為「將藍公路」，屬六號幹線一部份）正在興建中，當局安排該路線取道該幹線往返將軍澳至觀塘繞道，而棄用大部份將軍澳對外巴士路線途經的將軍澳隧道。建議文件中，本路線在將軍澳區走線與新巴798A線相約，但同時途經將軍澳南一帶（寶盈花園、將軍澳廣場、將軍澳站、將軍澳中心），來回程更途經香港科學園及白石角，而在大埔區走線亦繞經運頭塘、廣福、大埔太和路（大埔超級城、太和），再經汀太路及汀角路往返大埔工業邨。 建議出爐後，大埔區議會並不反對落實開辦，但要求把該路線於西貢區的總站設於將軍澳工業邨，亦有居民表示該路線繞經麗港城、白石角及運頭塘，導致車程過長，不建議在相關地點加設車站，並表示希望該路線假日也可提供服務。

經過公開招標程序，運輸署於2022年6月2日宣佈，九巴獲得將軍澳至大埔巴士路線的營運權。由於將軍澳藍田隧道及將軍澳跨灣連接路建築地盤受新型冠狀病毒疫情影響，工程受到延誤，直至2022年11月15日，當局公佈將軍澳—藍田隧道及將軍澳跨灣連接路於同年12月11日起正式通車，運輸署同時發表《配合將軍澳—藍田隧道及將軍澳跨灣連接路通車專營巴士服務安排》，建議於該幹線通車翌日（12月12日），開辦五條全新巴士路線，取道將軍澳—藍田隧道往返將軍澳，上述提及的招標路線亦為其中之一，編號定為96（即本路線），星期一至五早晚繁忙時間各對開兩班，開車時間亦與原建議的有異。

將軍澳—藍田隧道及將軍澳跨灣連接路最終如期於2022年12月11日早上8時正式通車，本路線亦於翌日（12月12日）投入服務，並提供各條將軍澳藍田隧道的九巴路線、將軍澳區及大埔區指定路線、九巴大老山隧道非過海路線及九巴獨營東隧過海路線的轉乘優惠。受地理環境所限，將軍澳藍田隧道轉車站只於藍田交匯處（往市區方向）設置，故此當局安排偉業街麗港公園巴士站，成為往將軍澳方向的轉乘站，同時方便麗港城居民及鄰近觀塘碼頭一帶商貿區上下班市民，有另一直達將軍澳、科學園及大埔的巴士服務選擇。

本路線的出現，令將軍澳居民往返香港科學園的交通費大幅降低（現時全程車費為$9.90，僅為香港科學園員工巴士SP6系列路線收費（現時全程收費$19.20）約一半），加上能直達九巴大老山隧道轉乘網絡未能覆蓋的運頭塘、大埔墟站、大埔太和路（大埔超級城）、汀太路、汀角路（太平工業中心、大元邨、富亨邨一帶），又能直達大埔工業邨，雖然大老山隧道至大埔工業邨之間的走線較74F線迂迴（該線取道吐露港公路、完善路直接往返大老山隧道至大埔工業邨） ，但對將軍澳及麗港城居民，本路線可以一程車直接往返上述地區；白石角居民又可乘搭本路線，取道觀塘繞道直接往返麗港公園，步行往返一橋之隔的觀塘碼頭一帶的商貿區上下班，避開交通繁忙的觀塘道，故此備受乘客歡迎，客量為九巴三條「將藍公路快線」（本路線、290E及298X線）中客量最高的。故此九巴於2023年1月向運輸署申請提升服務，最終本路線於2023年4月29日起，增設星期六及假日日間雙向服務，星期一至五早上往大埔方向及傍晚往將軍澳方向亦增加班次，成為首兩條每日行經將軍澳—藍田隧道的專營巴士路線之一（另一條為往返清水灣半島、日出康城至佐敦、尖沙咀的城巴790線）。入境事務處總部於2024年6月遷往將軍澳寶邑路，九巴於同年8月試辦黃昏繁忙時間由該處開往大埔方向的特別班，成功吸引該處下班客源，同年9月19日起該項特別班正式常規化。

本路線投入服務後，成為九巴首批取道將軍澳藍田隧道往返的專營巴士路線之一（另兩條為290E及298X線）；首條及唯一一條往返將軍澳至大埔的專營巴士路線；大埔區首條及唯一一條採用「90」系列的專營巴士路線。本路線現時全程收費只收 $9.90，比全程行車里數更短、往返大埔區（與本路線服務範圍相約甚至更遠）至觀塘的74E、74F、74X、274X線（全程收費分別為$16.20及$11.10）更要便宜，可見九巴為投得本路線而不惜工本。

康盛花園開，經：
林盛路，寶琳北路，寶寧路，常寧路，重華路，培成路，銀澳路，昭信路，寶邑路，將藍公路，藍田交匯處，茶果嶺道，偉業街，觀塘繞道，大老山隧道，大老山公路，澤祥街，科學園路，創新路，天橋，吐露港公路，達運道，南運路，大埔太和路，汀太路，汀角路，大發街及大昌街。

大埔工業邨開，經：
大貴街，汀角路，汀太路，大埔太和路，南運路，達運道，吐露港公路，創新路，科學園路，瑞祥街，大老山公路，大老山隧道，觀塘繞道，偉業街，茶果嶺道，藍田交匯處，將藍公路，寶邑路，昭信路，銀澳路，培成路，常寧路，寶寧路，寶琳北路及林盛路。