本路線提供水泉澳、多石、圓洲角、愉翠苑、牛皮沙新村、廣源、黃泥頭往返亞公角街、錦駿苑、恆安、耀安、馬鞍山市中心、錦英苑、利安、落禾沙及烏溪沙的巴士服務，於2017年12月9日起投入服務，初時總站為黃泥頭，烏溪沙站為循環點，以循環線運作。本路線為83A、83X及89D線服務重組而衍生的路線，現時由89D線抽調巴士行走。

九巴及運輸署分別於《2014-2015年度巴士路線計劃》（即「沙田區區域性巴士路線重組」）及《2016-2017年度巴士路線計劃》中，兩度提出83X線提升至全日服務（沙田端總站分別建議延長至沙田站及水泉澳），以取代89D於平日非繁忙時間及假日早上及晚上繞經黃泥頭的安排。於第二度建議83X線改為全日服務的諮詢期間，由於有部分黃泥頭、廣源居民及當區兩個選區的時任區議員，包括新民黨／公民力量陳敏娟（廣源選區）以及民建聯王虎生（廣康選區）（二人同於2019年區議會選舉中連任失敗），指出新界專線小巴808線經常出現滿座，而89D線全日不繞經黃泥頭會令前者爆滿情況更為嚴重，加上會令黃泥頭至馬鞍山一段的服務遭到削減，因此反對有關方案。

最終《2016-2017年度巴士路線計劃》的83X線的服務提升建議獲得通過，於2017年8月19日起實施，但89D線不經黃泥頭的方案卻被撤回。此舉引起馬鞍山居民極度不滿，認為九巴及運輸署有意偏袒黃泥頭及廣源一帶居民。有分析指，九巴及運輸署的安排有政治目的，由於馬鞍山較多泛民主派區議員，而黃泥頭的兩名區議員為建制派，九巴及運輸署是為了令建制派能製造「成功爭取」的政績，而拖垮整個計劃。其後，多個馬鞍山的Facebook專頁，均發起聯署行動，要求89D線撤出黃泥頭。

另一方面，鑑於新界專線小巴808線服務質素近年每況愈下，營辦商更面對車長人手不足的問題，加上沙田區議會、九巴及運輸署有意早日解決89D線不經黃泥頭及廣源後，往返該帶至馬鞍山的公共交通配套問題，經沙田區議會多名議員與九巴於2017年9月11日的會議後，時任沙田區議會交通及運輸委員會副主席容溟舟（公民黨）表示，九巴及運輸署計劃開設一條區內巴士路線，循環來往黃泥頭及烏溪沙站，編號為89S（即本路線），走線在亞公角街（東行）後依順時針方向繞經恆安、耀安、馬鞍山市中心、錦英苑、烏溪沙站，然後經馬鞍山繞道返回亞公角街（西行）。最終本路線於2017年12月9日起投入服務，平日提供早上繁忙時間後至晚上服務，假日則於日間提供服務，星期一至五早上時段另設單向由黃泥頭開往烏溪沙站的服務。在本路線投入服務當日起，89D線全日不再繞經黃泥頭及廣源，由提升至全日服務後的83X線提供往返黃泥頭、廣源至東九龍的服務。

其後，不少馬鞍山及廣源居民投訴專線小巴808線持續出現班次失準，即使該線引入低地台小巴服務，仍然未見改善，加上低地台小巴袛於星期一至五行走，未能全面服務往返威爾斯親王醫院覆診的馬鞍山居民，尤其長者及行動不便人士者為甚。在地區人士爭取下，運輸署終於2018年7月接納民主黨曾素麗議員（沙田區議會富寶選區）的提案，建議將本路線總站延長至圓洲角（星期一至五早上的單向特別班次仍維持於黃泥頭開出），旋即獲沙田區議會通過，於2018年11月19日起，總站延長至圓洲角，令馬鞍山居民在專線小巴808線以外，有另一選擇直達威爾斯親王醫院，也是繼九巴286P線（第一代）於2005年1月31日起停辦後，再次出現往返馬鞍山至圓洲角的專營巴士服務，也令圓洲角總站自2004年第一代286P線（已取消）延長至美林相隔14年後，再次成為專營巴士總站。

為方便水泉澳及小瀝源一帶居住的學生前往馬鞍山的學校上課，由2021年9月1日起，本路線早晨特別班次，延長由水泉澳開出，經多石街、沙田圍路、牛皮沙街、廣善街（廣源）、小瀝源路至黃泥頭巴士總站後，返回原有路線前往烏溪沙站。相隔四年後，九巴及運輸署於《2024-2025年度巴士路線計劃》中，建議本路線所有班次均延長至水泉澳，與早晨特別班次看齊，並取消循環運作，由烏溪沙站開出後，依89D線相同走線，抵達大老山公路後左轉小瀝源路原有路線至圓洲角巴士總站，再沿銀城街及多石街返回水泉澳。建議已獲沙田區議會交通及運輸委員會通過。其後，因應地區人士對落禾沙區內交通嚴重不足十分不滿，再加上香港城市大學於落禾沙興建的學生宿舍（命名為「李兆基學生宿舍村」）於2024年8月入伙，導致區內人口增長，運輸署於同年11月透過沙田民政事務處發出諮詢文件，建議在實施是年度巴士踏線計劃建議改動的同時，來回程繞經落禾沙一帶（烏溪沙路及耀沙路）。最終該項建議連同是年度巴士路線計劃的建議，一併於2024年12月22日起實施，而且尾車時間亦獲得延長至平日2315及假日1815於兩邊總站開出（原建議為平日尾車提早於2045於兩邊總站開出）。是項改動實施後，與城巴581線成為落禾沙首兩條全日服務的專營巴士路線。

現時本路線為全港唯一一條路線編號以S字結尾、並提供每天全日服務的專營巴士路線。

按此處進入2024年12月22日前的九巴89S線

水泉澳開，經：
多石街，銀城街，插桅杆街，圓洲角巴士總站，插桅杆街，牛皮沙街，廣善街，小瀝源路，黃泥頭巴士總站，小瀝源路，大老山公路，石門交匯處，亞公角街，恆信街，恆泰路，馬鞍山路，恆康街，西沙路，馬鞍山路，錦英路，西沙路，烏溪沙路，耀沙路，迴旋處，耀沙路，烏溪沙路及沙安街。

水泉澳開（特別班次），經：
多石街，沙田圍路，牛皮沙街，廣善街，小瀝源路，黃泥頭巴士總站，小瀝源路，大老山公路，石門交匯處，亞公角街，恆信街，恆泰路，馬鞍山路，恆康街，西沙路，馬鞍山路，錦英路，西沙路及沙安街。