本路線為46X線的輔助線，提供美田邨、美松苑、美林邨及大圍往來葵涌及港鐵葵芳站的巴士服務，於1992年4月27日起投入服務，最初是原本46X線由顯徑往葵芳（金龍中心）及葵芳地鐵站（現稱葵芳站）往顯徑的特別班次，1994年2月21日起46X線早上由荔景（南）開往顯徑的特別班次，亦編為46P（1995年3月31日起因荔景（南）總站因興建社區會堂工程永久封閉而取消）。1995年5月16日起下午繁忙時間班次延長至荔景（北），同年9月4日上午繁忙時間班次也一併延長，配合美松苑入伙，1997年2月17日起下午往顯徑方向繞經，2001年2月25日起與主線46X一起改為全空調服務。

本路線主要是舒緩46X線於繁忙時間客量，然而本身的客量亦相當龐大，但因早上班次行車路線與46X線完全相同，為善用資源，於2005年6月27日起取消早上班次。配合美田邨入伙，由2006年9月25日起往顯徑方向繞經該處。

因應四美一帶人口增長，同時為精簡路線網絡，九巴在《2013-2014年度沙田區巴士路線發展計劃》，建議合併本路線及46S線，編號仍為46P，提升為平日上下午繁忙時間提供服務，早上繁忙時間提供美田單向開往葵芳站的服務，下午繁忙時間則提供美田至葵芳站的雙向循環服務，以葵芳站作循環點，不再服務顯徑、隆亨、新翠及荔景，以上地區的服務改由主線46X提供。建議最終獲沙田區議會交運會通過，於2014年1月4日起實施，成為首條專門服務美林、美田一帶的城門隧道巴士路線。

按此處進入2014年1月4日前的46P

美田開（下午班次），經：
美田邨通道，香粉寮街，美田路，迴旋處，美田路，大圍道，大埔公路，城門隧道公路，城門隧道，和宜合交匯處，和宜合道，昌榮路，昌榮路迴旋處，葵涌道，葵富路，葵仁路，葵義路，葵芳站巴士總站，葵義路，葵富路，葵涌道，昌榮路迴旋處，昌榮路，和宜合道，和宜合交匯處，城門隧道，城門隧道公路，大埔公路，大圍道，美田路，迴旋處，美田路，美輝街及香粉寮街。