本路線提供葵涌東北（石蔭、安蔭、石籬、和宜合道）及梨木樹往返沙田第一城、石門商貿區及香港科學園的巴士服務，於2020年12月21日起投入服務，為葵涌東北及梨木樹居民提供直達沙田區及香港科學園上下班的巴士服務，初時由石蔭單向開往香港科學園，袛於星期一至五早上繁忙時間開出一班，由43X線抽調巴士行走本路線。

城門隧道於1990年4月20日通車，當日起投入服務的九巴46X線，往沙田方向曾途經石籬一段的和宜合道，城門隧道轉車站於1991年5月26日啟用後，九巴為免該線行車時間過長而撤出石籬區，導致該區失去直接往返沙田區的公共交通，之後接近三十年來該帶均沒有直達巴士前往城門隧道轉車站及新界東。即使後來進智公交於該區先後開辦途經城門隧道的專線小巴403、403A、403X及403P線，仍然未能應付當區前往沙田的需求。

因此，早於《2018-2019年度巴士路線計劃》，九巴及運輸署曾建議開辦一條由石籬（大隴街）開往沙田市中心的47B線，於星期一至五早上開出一班，惟由於該線需由47X線抽車行走，被工聯會黨籍的時任葵盛西選區區議員劉美璐，以影響葵盛居民前往沙田而反對建議，結果原有建議遭到撤回，惹來北葵涌地區人士不滿。

相隔兩年後，九巴及運輸署於《2020-2021年巴士路線計劃》，建議開辦一條由北葵涌直達沙田第一城、石門商貿區及香港科學園的晨早巴士服務，編號為43S（即本路線），於星期一至五早上繁忙時間開出一班，在石蔭開出後，繞經石蔭東邨、安蔭邨及石籬邨，然後取道和宜合道，直達城門隧道轉車站前往沙田，方便葵涌東北及梨木樹居民直達上述地點上班，及於城門隧道轉車站轉乘其他前往沙田其他地區、大埔及北區的巴士路線，而不需利用31M及235M線的轉乘。建議經葵青及沙田區議會交運會通過後，本路線於2020年12月21日起投入服務。

為方便香港科學園上班的乘客於黃昏時段返回葵涌東北，在本路線投入服務的四年後，九巴及運輸署於《2024-2025年度巴士路線計劃》內，建議本路線增設一班黃昏回程服務，由香港科學園（科技大道西集成電路開發中心對出）起載，經大老山公路、大涌橋路（石門、沙田第一城）、大埔公路沙田段及城門隧道，直達梨木樹及葵涌東北。建議獲葵青及沙田區議會交通及運輸委員會通過後，於2024年12月16日起實施。

值得一提，43S這個編號，已是第四次使用，第一代43S線為臨時路線，於1985年5月由臨時路線43A（第一代）更改編號，袛於油麻地小輪青衣至荃灣航線暫停服務時行走，因該渡輪航線於1988年8月27日起停辦而不再提供服務；第二代43S線於1993年10月11日起投入服務，往返葵芳地鐵站（現稱葵芳站）至香港科技學院（青衣）（現稱香港專業教育學院青衣分校），由職業訓練局租用九巴巴士接載該校學生上下課，但只服務一個月便於同年11月12日起停辦；第三代43S線為節日特別路線，於1994年2月10日起投入服務，由荃灣地鐵站單向開往美景花園，袛於農曆年初一凌晨行走，1997年2月6日起改稱N43，現在再重用。

目前，在眾多途經城門隧道的巴士路線，僅有本路線於葵涌東北作總站，而且只限繁忙時間路線。

按此處進入2024年12月16日前的九巴43S線