本路線提供龍門居、青山村、杯渡路、屯門站、屯門市中心、安定／友愛、豐景園及屯門公路轉車站往返九龍灣商貿區及觀塘商貿區的巴士服務，回程加經業旺邨，於2022年5月3日起投入服務，為龍門居、富健花園、屯門市中心、安定／友愛、豐景園一帶居民提供特快往返九龍灣商貿區及觀塘商貿區上班的服務，初時袛在星期一至五早上繁忙時間開出一班。

未有本路線以前，屯門區於早上繁忙時間直達九龍灣商貿區及觀塘商貿區的專營巴士服務，計有服務屯門西北、大興及山景的258X線，及服務屯門南的259X線，屯門其餘地區則未有同類服務。因應屯門市中心、安定／友愛、豐景園一帶居民前往九龍東商貿區的需求，九巴及運輸署於《2020-2021年度巴士路線計劃》內，建議259X線加開一班特別班次，由龍門居開出，經皇珠路、屯門市中心、安定／友愛及豐景園，然後依259X線相同走線前往九龍灣商貿區及觀塘商貿區，並停靠屯門公路轉車站，以觀塘碼頭為終站。建議經屯門區議會交通及運輸委員會商討後，該項特別班次獲獨立編號為259S（即本路線）。本路線原擬於2022年2月14日起投入服務，不過因新型冠狀病毒疫情，結果要延遲至同年5月3日才正式投入服務。

受路面設計所限，本路線需繞經皇珠路（東行）兩次，並沿屯門公路（北行）駛往屯門市中心巴士總站。為減少重覆駛經有關路段，及為增強青雲路及杯渡路一帶前往東九龍商貿區的巴士服務，九巴及運輸署於《2023-2024年度巴士路線計劃》內，建議本路線在龍門路後改經青雲路及杯渡路，然後返回屯門鄉事會路原有路線，除維持服務穩定性外，更方便青雲路及屯門站一帶居民。建議獲屯門區議會交通及運輸委員會通過後，於2023年9月18日起實施。

籌備多年、歷時八年興建的中九龍幹線（正式名稱為中九龍繞道），於2025年第四季落成，落成通車後將連接東西九龍，藉此縮短往返包括油麻地及九龍灣道路網一帶的行車時間。為提供更便捷的巴士服務方便乘客往返屯門及九龍東一帶，在中九龍繞道行將落成通車之際，九巴及運輸署於《2025-2026年度巴士路線計劃》中，建議本路線改經西九龍公路、中九龍繞道（油麻地段）及啟祥道，不再經東九龍走廊、啟德隧道，及增設黃昏繁忙時間回程服務，取道中九龍繞道駛往西九龍公路前往屯門，於屯門區內更繞經業旺邨。2025年11月26日，行政長官李家超在國際鐵路安全理事會致辭時，宣佈中九龍繞道（油麻地段）將於12月21日通車，並於同年12月16日由運輸署、警方及路政署聯合記者會中，宣佈該幹線於通車後翌日（12月22日），將有三條全新路線及五條現有路線駛經該幹線往來，本路線為五條現有路線的其中一條，於該幹線通車後翌日實施相關改道及增設黃昏回程服務，令往返東九龍商貿區上下班的屯門龍門居、屯門市中心、安定／友愛及豐景園居民有另一特快選擇，不需途經交通繁忙的呈祥道及龍翔道，節省行車時間。本路線來回程的電子地點牌更加入「中九龍繞道特快」分頁，表示本路線取道中九龍繞道往返新界至九龍東。

由於本路線深入九龍灣及觀塘商貿區心臟地帶，為乘客節省了乘搭接駁巴士及步行時間，比62P及259D線更快捷，但收費比起該兩線為高。

按此處進入2025年12月22日前的九巴259S線

龍門居開，經：
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